研究發現，約每200例樣本就有一例有交叉汙染，或是樣本標示錯誤的情況。此外，大約有22.5% 的樣本會因為DNA品質不良而導致後續實驗失敗。如果定序前只使用傳統吸光值測定DNA濃度，將無法檢測出DNA碎裂化的樣本，而使實驗失敗、甚至有定序資料錯誤的風險。
.有什麼QC產品能解決上述狀況呢?
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.Agena 公司的MassARRAY分析系統，針對不同樣本分析需求，設計了三合一QC檢測!
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- 樣本鑑定功能
幫助您了解樣本是否正確，以及是否受到交叉汙染 - 核酸定量
了解DNA濃度是否足以進行後端實驗分析 - 核酸序列完整性
了解DNA樣本的序列完整性，確認是否適合進行後端實驗分析
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相關產品包括Sample ID、Exome QC、Liquid IQ、Chimeric ID，客戶可以根據不同需求選購不同套組。
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Sample ID
適合biobank客戶，可以為每支樣本建立獨一無二的build-in barcode，並同時測量DNA的短片段拷貝數。精選 44個位於intron及exon區域的高變異度 SNPs，以及3個性別位點。
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Exome QC
針對Exome sequencing樣本設計的品管試劑套組，和sample ID一樣，具有樣本鑑定、品質分析、定量分析的功能。此外，可分析序列片段100, 200, 300, 400 及 500 的DNA拷貝數，精確判斷樣本DNA的完整性。精選 21個位於exon區域的高變異度 SNPs，以及3個性別位點。
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Liquid IQ
針對Liquid Biopsy樣本設計的品管試劑套組，具有cfDNA樣本鑑定、品質分析、定量分析的功能。可以偵測樣本中是否帶有細胞壞死釋出的長片段DNA以及cfDNA萃取後殘留的PCR抑制物。並測量cfDNA的拷貝數，估算樣本中白血球DNA污染的程度。精選21個SNPs位點，方便比對liquid biopsy及組織樣本的序列資料，避免分析或資料配對錯誤。
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Chimeric ID
針對核酸混和物、樣本汙染、區分母體及胎兒DNA，或是監測器官移植成功率等目的進行的SNP分析(取代STR分析)。在主要的6個HapMap族群資料庫中，精選92個次等位基因頻率(minor allele frequency, MAF)高，且沒有連鎖不平衡(linkage disequilibrium)的SNPs，可以有效分析最低2%的樣本混和比例。
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若對上述產品有興趣或有任何疑問，歡迎來電: (02) 2351-9800