總基因體分析

總基因體分析 Metagenomics

針對16S rRNA變異區進行定序，可分析各類型直接採樣樣本，如臨床體液、土壤或者是食品等，可以應用在分析腸道菌相、皮膚菌相及環境土壤菌相等多種不同領域。以宏觀的角度分析菌相變化，突破傳統培養分析的盲點，也可以分析以往無法培養的菌群，隨著次世代定序技術的成熟，在目前文獻研究中已有許多重大發現，是目前微生物領域中新興的熱門研究題材。

我們的分析服務一個樣品有至少10萬筆 illumina NGS reads，進行分類學上界、門、綱、目、科、屬、種不同層級的分析，可以精確了解已知微生物的量化組成與未知微生物比例，且我們提供完整的分析服務流程，從取得DNA後到定序分析以及後續比對分析，您可取得一份完整的比對報告，讓您可以容易的進行總基因體學研究分析。

總基因體技術原理

總基因體分析以16S rRNA gene variable region定序方式，進行樣本的總菌相分析，先以16S rRNA 高度保留區序列引子進行總菌群的序列擴增，再將擴增產物接上adapter建置成文庫 (library)，將此文庫進行次世代定序，再使用定序數據進行比對分析，使用RDP Classifier以GreenGenes資料庫進行分類，可以分類至species層級，定序讀數也可反應樣本中菌量比率。