總基因體分析 Metagenomics 針對16S rRNA變異區進行定序，可分析各類型直接採樣樣本，如臨床體液、土壤或者是食品等，可以應用在分析腸道菌相、皮膚菌相及環境土壤菌相等多種不同領域。以宏觀的角度分析菌相變化，突破傳統培養分析的盲點，也可以分析以往無法培養的菌群，隨著次世代定序技術的成熟，在目前文獻研究中已有許多重大發現，是目前微生物領域中新興的熱門研究題材。 我們的分析服務一個樣品有至少10萬筆 illumina NGS reads，進行分類學上界、門、綱、目、科、屬、種不同層級的分析，可以精確了解已知微生物的量化組成與未知微生物比例 ，且我們提供完整的分析服務流程，從取得DNA後到定序分析以及後續比對分析，您可取得一份完整的比對報告，讓您可以容易的進行總基因體學研究分析。 總基因體技術原理 總基因體分析以16S rRNA gene variable region定序方式，進行樣本的總菌相分析，先以16S rRNA 高度保留區序列引子進行總菌群的序列擴增，再將擴增產物接上adapter建置成文庫 (library)，將此文庫進行次世代定序，再使用定序數據進行比對分析，使用RDP Classifier以GreenGenes資料庫進行分類，可以分類至species層級，定序讀數也可反應樣本中菌量比率。 總基因體分析服務流程與方式 實驗諮詢與樣本確認 客戶提供DNA樣本 文庫製備與定序分析 數據分析取得報告 總基因體分析檢體需求 檢體形式 : 樣本萃取DNA 檢體品質要求 : OD 260/280 ratio 1.8~2.0 檢體量需求 : [...]

標的定序分析 Targeting Sequencing Targeting Sequencing技術是先篩選出特定目標基因後，再進行次世代定序分析，可以將定序資源集中在欲分析的特定區域，提供高解析度與高質量的數據。定序數據可用於發現未知突變或確認已知突變，也可提供定序筆數用於分析突變比例。此外，也可用於分析 Copy Number Variation。目標篩選適合選擇數十到數百的區域範圍進行分析。 Targeting Sequencing技術原理 依據目標基因與樣本的型態、長度，採用不同的目標篩選技術，如Probe Capture、Long range PCR、Short range PCR等方式進行目標篩選。再以Ligation或Transposome等方式建製文庫 (Library)，再進行次世代定序並分析數據。 客製化標的定序分析服務 我們採用多種不同目標篩選策略，可以針對不同基因數目與要分析的標記型態，提供最佳的定序策略。並提供全客制設計分析服務，配合您感興趣的基因，設計專屬您的基因序列定序方法，提供高效率與高準確性的定序結果。針對癌症相關分析可以挑選關聯性癌症基因進行分析，以高定序深度分析微量突變，可針對不同類型研究目的進行全客製化的分析方法。 標的定序分析服務流程與方式 設計服務與實驗諮詢 客戶提供檢體給本公司進行分析 實驗分析與數據判讀後取得報告 標的定序分析檢體需求 檢體形式 : 樣本萃取DNA 檢體品質要求 : OD 260/280 ratio 1.8~2.0 [...]

NGS分析服務 採用illumina定序平台提供NGS多元定序服務，提供高質量、低錯誤率的高量定序數據。 NGS分析原理 將想要分析序列片段化，接上定序標記序列完成序列文庫，即可轉入NGS定序儀，進行分子擴增，在定序反應中進行高通量同步定序，儀器使用光學讀取每個訊號點的鹼基定序訊號，即可取得超過數百萬筆定序數據，高通量定序技術可以搭配不同的文庫建構技術，應用各種基因體研究分析如Targeting gene sequencing、RNA Sequencing、Metagenomics等多元應用。 分析服務特色 提供高通量定序數據 定序資訊可應用於未知序列變異分析 定序讀數可應用於CNV等變異分析 高彈性且高效率的多元應用目的與分析流程 客製化實驗規畫諮詢與生物資訊分析 附件下載： Service Brochure

iPLEX Gold SNP分型原理 此反應包含MultiPlex PCR amplification、Single nucleotide extension、Mass detection三個步驟。可用於分析含SNP、CNV、InDel等各種不同型式之序列變異性。 PCR amplification：由一對專一性primer將包含Target SNP site約一百個鹼基大小的片段進行增幅反應。 Single nucleotide extension：由一條黏合於Target SNP site正前方的extension primer進行單一鹼基延伸反應。 Mass detection：由於單一鹼基可合成出四種鹼基A、T、C、G，可利用質譜分析產物分子量，以此方法得知Target SNP site的定型結果。 iPLEX Gold SNP客製化分型優勢 本分析方式具有高通量、高效率之特性，一個well反應可設計高達40個SNP 位點，因此可大幅減低珍貴檢體的分析耗損量。由於實驗中不須採用蛋白或螢光標定之 primer，因此可提供您最高經濟效益的SNP分析方法，具有前未有的實驗彈性，不需等待原廠為您特製任何探針或偵測 primer，即可立即分析。透過 Agena 專用設計軟體 Assay Designer，可協助您完成上達數百位點的 SNP 實驗，為目前轉譯醫學研究領域 SNP 驗證重要的分析工具。 iPLEX gold 反應是在 [...]

核酸質譜分析平台 MassARRAY System 全球領先、唯一將MALDI-TOF質譜原理應用於核酸分析的技術平台。其分析包含SNP分析、DNA甲基化分析、基因表達定量、序列比對等多種應用功能，並提供準確性、高效率兩大需求，是高檢體量研究計畫的最佳選擇。 MassARRAY技術原理 分析過程中DNA樣本在SpectroCHIP形成結晶，經高能雷射激發結晶，使DNA分子游離化後進入帶有電場的真空時間飛行管中，再由偵測器分析不同分子量之分析物的飛行時間，以推算出分析物分子量圖譜。 在核酸分析上能夠分析1000Da 到10000Da，可分析3~30個核苷酸的分子，配合多種不同反應設計能夠應用於多種應用分析。 MassARRAY分析平台特色與優點 質譜偵測技術提供優異靈敏度與準確率 價格便宜、不需訂購特製螢光探針 彈性且高效率的實驗設計 優異的花費效益與樣本容載率 MassARRAY分析服務流程與方式 客戶準備想分析的SNP rs number清單或是序列清單 挑選預先設計分析Panel 本公司進行Primer設計與實驗評估 客戶提供檢體、檢體清單給本公司進行分析 產出結果報告 MassARRAY分析檢體需求 檢體形式 : 96 盤裝 Genomic DNA 檢體品質要求 : OD 260/280 ratio 1.7~2.0 適用檢體 [...]